La Struttura si occupa della donazione di organi e tessuti nell’Area milanese di competenza (in Lombardia sono state individuate 18 Aree) che comprende, oltre all’Ospedale Niguarda, anche: l’Ospedale San Paolo, l’Ospedale San Carlo, l’Istituto Galeazzi e le Case di cura San Pio X e San Giovanni.
In particolare, la Struttura si occupa di promuovere iniziative di informazione e di formazione rivolte ai cittadini e agli operatori sanitari sul tema dei trapianti, sia all’interno dell’Azienda che sul territorio.
La Struttura lavora in stretta collaborazione con le altre Strutture dell’Ospedale dedicate alle attività di trapianto di organi e tessuti (come la Banca della Pelle, di recente costituzione), e con le associazioni come l’AIDO (Associazione Italiana Donatori d’Organi).
Il coordinamento prelievo di organi e tessuti fa riferimento al Coordinatore regionale ed al CIR-NITp, nell'ambito dell'organizzazione nazionale prevista dal CNT.
Il costante incremento dell'attività di prelievo d’organi e tessuti conferma la strategicità del ruolo dell’Azienda Ospedaliera nel sistema: In particolare l'attività si è caratterizzata per: